Jacob Portman, um adolescente de 16 anos, cresceu ouvindo as fantásticas histórias de seu avô sobre um orfanato em uma ilha remota, habitado por crianças com habilidades extraordinárias e protegido de monstros sombrios. Após uma tragédia familiar inexplicável e perturbadora, Jacob decide investigar as últimas palavras enigmáticas de seu avô, embarcando em uma jornada para a misteriosa ilha galesa.

Lá, ele descobre as ruínas do Orfanato da Srta. Peregrine e, para sua surpresa, encontra as crianças peculiares das histórias de seu avô, vivendo em um "loop" temporal que as protege de um perigo iminente. Jacob se vê imerso em um mundo onde o tempo é maleável e o extraordinário é a norma, mas também onde ameaças inimagináveis espreitam nas sombras.

Ele precisa desvendar os segredos do orfanato e o passado de seu avô para proteger essas crianças e, talvez, descobrir seu próprio lugar neste universo peculiar. Uma aventura sombria e emocionante que mistura fantasia, mistério e fotografias vintage assustadoramente belas, convidando o leitor a questionar o que é real e o que é apenas imaginação.